Hlavním účelem ačepel mikrotomuje řezat jednotné, ultra{0}}tenké řezy (obvykle 0,5 až 60 mikrometrů tlusté) zapuštěných biologických nebo průmyslových vzorků. Tyto řezy se poté umístí na sklíčka, obarví se a zkoumají pod mikroskopem.
Klíčové aplikace:
- Histologie (lékařský/biologický výzkum): Řezání částí lidské nebo zvířecí tkáně (např. jater, kůže, nádorů) k diagnostice nemocí, jako je rakovina.
- Patologie: Příprava vzorků chirurgické biopsie pro rychlou analýzu během nebo po operaci.
- Botanika: Krájení stonků, listů nebo kořenů rostlin za účelem studia buněčné struktury.
- Neurověda: Vytváření tenkých řezů mozkové tkáně pro mapování nervových spojení.
- Věda o materiálech: Řezání polymerů, plastů, textilií nebo dokonce tvrdých materiálů, jako jsou kosti nebo zuby pro kontrolu kvality.

